由于哈尔滨医药集团公司制药总厂超标排放污水和废气，导致哈尔滨市哈西地区环境被严重污染，当地居民生活受到极大的影响。为减少对城区居民生活环境的影响，同时满足国家新版GMP认证的需要，推进企业产品结构升级，哈药集团制药总厂就新厂区项目与哈尔滨市阿城区政府正式签订协议。新厂区一期工程预计投资20亿元，哈药集团称之为“哈药有史以来最大的环保技改投资项目。”
哈药总厂自上世纪60年代建厂以来，一直坐落于哈尔滨市西郊。然而，随着近年哈尔滨城市建设的加快进行，哈药总厂附近由最初的荒野逐渐成长为集居住、院校、医疗、商业、物流等各项功能齐全的城市综合体。而坐落于此的哈药总厂也因为生产过程中产生的异味，越来越多地遭到附近居民的不满。2011年6月，因全国多家媒体的报道，哈药总厂因污染问题被推到了舆论的风口浪尖，最终促使哈尔滨市政府做出决定将哈药总厂搬出主城区。
哈药总厂的搬迁受到了许多哈尔滨居民的欢迎。家住药厂附近学府路与保健路交口的哈尔滨市民张艳双说，她住在这里20多年了，对于这片区域有着特殊的感情，周围交通便利，配套设施成熟，本想在自己的身边也给儿子买套房子当婚房，但由于受药厂药味的困扰，一直犹豫不决。“现在听说药厂马上搬迁了，我终于可以下决心出手买房了，这下孩子住得离我们近了，遇事照应起来也方便。”
据哈市环保局环境监察支队队长彭旭介绍，被哈市市民诟病的哈药总厂废水超标排放到城市内河的问题，也有望从根本上解决。去年下半年，哈市成立了由市长林铎任总指挥的“三沟一河”综合治理指挥部，包括哈药总厂排污流经的何家沟在内的“三沟一河”都被纳入综合整治范围，排污管网铺设后，哈药污水将不再明排。
